Питомник редких видов журавлей входит в научный отдел заповедника и выполняет две функции: исследование биологии журавлей и хозяйственная деятельность, связанная с уходом за журавлями и их разведением.
Основная цель создания Питомника – сохранение генофонда находящихся под угрозой исчезновения видов и популяций журавлей России, в первую очередь, эндемика России – стерха. Питомник был и остается основным звеном в работе по возвращению в природу этого вида.
Размножающиеся пары журавлей (маточное поголовье) живут в Питомнике постоянно. Общее число журавлей в последние годы составляло от 50 до 70 особей.
Все семь видов журавлей российской фауны живут и размножаются в Питомнике: серый, даурский, японский, черный, канадский журавли, стерх и красавка.
Журавли – птицы семейные, поэтому в Питомнике живут парами. Для каждой семьи выделены и отгорожены от соседей часть зимнего помещения и уличный выгул, разделенные дверью.
Основная работа сотрудников заключается в уходе за журавлями. Надо приобрести, наловить или вырастить корма, накормить птиц, обеспечить бесперебойную работу водопровода и электроснабжения, содержать в чистоте вольерные комплексы и подсобные помещения, проводить ремонты и усовершенствования вольер и помещений, благоустраивать территорию, лечить больных…
С 1984 г. ведутся подробные дневники, в которых записываются все события, касающиеся здоровья, поведения, кормления, физиологического состояния журавлей. В последние годы журавлям предоставляется все больше возможностей для самостоятельного размножения (насиживание кладки, выращивание птенцов), что улучшает количественные характеристики разведения и, что самое главное, повышает качество потомства, предназначенного для выпуска в природу или дальнейшего разведения.
Потомство содержащихся в Питомнике стерхов ежегодно с 1992 г. выпускали в местах исторического обитания вида на гнездовании (Куноватский заказник в Ямало-Ненецком АО, Уватский район Тюменской области), в местах остановок во время осенней миграции (Белозерский заказник в Тюменской области; Астраханский заповедник) и на зимовках (водно-болотные угодья близ г. Фередункенар, Иран; национальный парк Кеоладео, Индия).